重庆大学附属三峡医院男性科始建于20世纪90年代，是重庆市内国家三级甲等公立医院开设最早、目前规模最大的独立男科。经过近30年的发展，现为中华医学会中国男科基层实践（重庆）基地、中国男科基层优秀品牌科室、中国男性精子功能与生育力评估大数据研究西南分中心、重庆市中医药重点学科、重庆市中医重点专科。目前为中国性学会基层泌尿男科分会副主任委员单位、中国性学会中医性学分会副主任委员单位、中国医药科普分会副主任委员单位、中国尿道下裂委员会副主任委员单位；重庆市性学会性康复专业委员会主任委员单位、重庆市中西医结合学会男科分会副主任委员单位、重庆市医师协会男科分会副会长单位、重庆市医学会青委会副主任委员单位；万州区计划生育协会理事单位。

男性科开放床位50张，拥有专业技术人员23人，含中高级职称18人，硕士、博士研究生6人。其中重庆市主任及副主任委员9人次，国家级副主任委员5人次，国家级委员19人次，获重庆市名中医1人次，“首批中国中西医结合青年名医” 1人次。获批重庆市名老中医王顺德工作室重庆市名中医师带徒专家工作室。学科近年获国家自然科学基金3项，参与中华医学会等国家级指南及专家共识撰写7部。

学科为成都中医药大学等4所高校实习基地，且常年接受全国各地进修。近年来协助云贵川渝粤浙鄂等省份单位培养合格男科专科医生100余人次。学科携手国内42家单位成立“中国男科三峡联盟”，协助广东省深圳市龙岗区中心医院、四川省遂宁市中心医院、浙江省金华市中西医结合医院等17家兄弟医院设立了男性专科或男科学组。