2004年4月肝病科从感染科分离成为独立的科室，简称为肝病中心，位于原灭菌制剂室改建而成的二楼，在急救大楼设立2个门诊室。
2007年1月30日肝病科搬迁至御安分院二楼，设立2个病区，开放床位50张。
2010年肝病科获得重庆市万州区医学重点学科消化内科（肝病）。
2011年成立万州区肝病研究所，建立一所设备、人员齐全生物细胞研究室。
2012年科室更名为：肝病病区。
2012年成立国家药物临床试验基地，成功开展5多项药物临床试验。
2012年授予全国中医药防治传染病临床基地。
2012年授予中华医学生物免疫学会理事单位
2017年科室更名为：肝病科。
2018年肝病科获得重庆市区域重点专科感染科。
2018年授予渝东北肝病与感染病专科联盟“理事长单位”
2019年授予全国脂肪肝规范诊疗中心。
2019年授予《肝博士》杂志科普教育基地。
2019年授予全国“一百千万工程”肝病培训基地。
2019年8月授予慢乙肝临床治愈“珠峰”项目重庆分中心。
2020年5月肝病科搬迁至平湖分院，负一楼，设立2个病区，开放床位64张。
2020年6月授予全国脂肪肝数据管理中心建设项目实施单位。
2020年9月授予防治肝癌“绿洲”项目重庆分中心。
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